DICOM Viewer

Здесь обсуждаются все вопросы, не попадающие под другие категории
Аватара пользователя
anyr
Неотъемлемая часть форума
Сообщения: 380
Зарегистрирован: 11 апр 2006, 16:25
Откуда: Гомель

DICOM Viewer

Сообщение anyr »

Может кто-то сталкивался с изображениями в формате dicom и дополнит/исправит меня. DICOM изображения используются в медицине (КТ, МРТ, ангиография). В большинстве случаев возникает необходимость в просмотре этих изображений и только. Всякие чудо фильтры и Х-мерные обработки необходимы не часто.

Минимальный функционал для просмотра обеспечивают программы, записанные на эти диски, как правило это кастрированная версия eFilm или смотрелка от GE (они записываются автоматически на диск при записи исследований на него). Программы эти в linux не работают.

Пытался найти смотрелку со следующими особенностями:
    1. должна уметь открывать dicomdir (это список файлов/изображений на диске с дополнительной служебной информацией); без этого придется каждую серию изображений, или даже отдельные изображений открывать по-отдельности (серий может быть десятки, а отдельных изображений сотни), что неудобно.
    2. умеет "прокручивать" снимки в серии мышью... такие возможности, как масштабирование, изменение яркости и контраста как правило умеют все.

Искал в основном на I do imaging http://is.gd/kMa7bf

Mango http://is.gd/M28Ajg
• есть поддержка dicomdir, но воспользоваться ей не удалось из-за ошибки, возможно связанной с регистром букв
• нет прокрутки кадров

Aeskulap http://is.gd/sPK3J1
• проблема с регистром букв
• нет прокрутки кадров, зато сеть ползунок, который можно к этому делу худо-бедно приспособить

Amide http://is.gd/GQFCiE
• конвертер, а не смотрелка

Mayam http://is.gd/lrbsY2
• есть поддержка dicomdir, но воспользоваться ей не удалось из-за ошибки, возможно связанной с регистром букв
• нет прокрутки кадров (проверил в версии для windows)

Ginkgo CADx http://is.gd/OUpDSU
• проблема с регистром букв
• нет прокрутки кадров

Bioimagesuite http://is.gd/VeLIVO
• не умеет читать dicomdir
• тормозное

В итоге нарисовалась специфическая для linux проблема с регистром букв. В dicomdir пути к файлам изображений могут быть не в том регистре, в каком они реально записаны на диск. Для windows - это не важно. Для linux - имеем проблему. Ни одна программа с заявленной возможностью открывать dicomdir не справилась с этим (хотя служебную информацию из файла читали правильно). И судя по выхлопу в консоли и логам - везде одни и те же грабли.

Что делать?!
    1. Написать на все программы багрепорты и требованием убрать чувствительность к регистру символов?
    2. Монтировать cd без чувсвтительности к регистру? Вроде есть r[relax] для vfat

Посоветуйте в какую сторону тонеля лететь.

leave
Неотъемлемая часть форума
Сообщения: 1055
Зарегистрирован: 25 окт 2006, 14:50
Откуда: minsk
Контактная информация:

Re: DICOM Viewer

Сообщение leave »

Писать багрепорт

Аватара пользователя
anyr
Неотъемлемая часть форума
Сообщения: 380
Зарегистрирован: 11 апр 2006, 16:25
Откуда: Гомель

Re: DICOM Viewer

Сообщение anyr »

В очередной раз решил подойти к данному вопросу. На данный момент результат такой: названия файлов в DICOMDIR положено по стандарту в верхнем регистре и менять что-либо в разрез со стандартами не в интересах программистов. Их понять можно.

Идти обход пока не очень получается.

Если речь идет про FAT, то для этих случаев есть параметр монтирования FS shortnames=mixed и он используется по-умолчанию в свежих и относительно свежих дистрибутивах linux.

Но если речь идет про ISO9660 (а именно на дисках в основном и распространяются DICOM изображения), то тут ничего не выходит. При использовании опции монтирования map=off регистр в именах файлов становится такой как нужен, но появляется другой косяк: в корне диска лежит тот самый DICOMDIR, который с этой опцией становится DICOMDIR.;1. Как избавится от завершающей комбинации - не знаю. Пробовал nojoliet и norock (на всякий случай) - без успеха.

Может у кого-нибудь есть мысли, как это победить?

Аватара пользователя
anyr
Неотъемлемая часть форума
Сообщения: 380
Зарегистрирован: 11 апр 2006, 16:25
Откуда: Гомель

Re: DICOM Viewer

Сообщение anyr »

В Weasis, который является частью проекта dcm4chee проблема с разным регистром букв в названиях файлов решена в версии 1.1.3 (релиз состоялся 2-го августа 12 года). Скачать portable версию можно по адресу: http://is.gd/cgjaOp

Weasis представляет из себя вполне приличную программу для просмотра и анализа изображений. Есть немного путаница с очередностью серий изображений, но в целом - очень даже ничего: не тормозит, умеет открывать диски с dicomdir.

Скришоты
Изображение
Изображение

Ответить